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Deep Learning Tools/NEURON

Neuron integrate and fire (IAF) model

neuron은 membrane potential이 threshold에 닿았을 때 action potential이 fire한다.

그 값은 대략 -55~-50mV 정도이다.

Integrate and fire model(IAF model)은 membrane potential이 threshold value에 다다랐을 때, action potential이 발생한다.

 action potential이 발생한 이후에 potential은 reset 상태로 가면서 threshold 아래로 떨어지게 된다.

threshold value는 %5Ccombi%20_%7B%20th%20%7D%7B%20V%20%7D%20로 표현하고, reset value는 %5Ccombi%20_%7B%20reset%20%7D%7B%20V%20%7D%20 으로 표현한다.

따라서 %5Ccombi%20_%7B%20reset%20%7D%7B%20V%20%7D%5Cquad%20%3C%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20th%20%7D%7B%20V%20%7D%20의 관계가 만들어진다.


IAF모델은 action potential에 대한 생물학적 작용을 무시함으로써 subthreshold의 membrane potential만 고려하는 매우 단순한 모델이 되었다.


이 모델의 단순한 버전은 모든 membrane conductances와 synaptic inputs를 무시하는 것이 있다.

마치 single passive leakage term으로, %5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20i%20%7D%3D%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20%5Cbar%20%7B%20g%20%7D%20%7D(V%5Cquad%20-%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20E%20%7D)%20로 표현한다.

이러한 모델을 passive 혹은 leaky integrate and fire model 이라고 한다.


이 모델은 resistor와 capacitor가 병렬적으로 연결된 마치 전자 회로처럼 여겨질 수 있다.

그리고 이에 대한 membrane potential은 다음과 같이 표현할 수 있다.


%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20c%20%7D%5Cfrac%20%7B%20dV%20%7D%7B%20dt%20%7D%5Cquad%20%3D%5Cquad%20-%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20%5Coverline%20%7B%20g%20%7D%20%7D(V%5Cquad%20-%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20E%20%7D)%5Cquad%20%2B%5Cquad%20%5Cfrac%20%7B%20%5Ccombi%20_%7B%20e%20%7D%7B%20I%20%7D%20%7D%7B%20A%20%7D%20 


위의 수식에 특정한 membrane resistance인 %5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20r%20%7D%20을 곱한다

이는 %5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20r%20%7D%5Cquad%20%3D%5Cquad%20%5Cfrac%20%7B%201%20%7D%7B%20%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20%5Coverline%20%7B%20g%20%7D%20%7D%20%7D%20으로 정해진 값이다.


%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20%5Coverline%20%7B%20g%20%7D%20%7D%20은 사라지며 %5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20c%20%7D%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20r%20%7D%5Cquad%20%3D%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20%5Ctau%20%20%7D%20 을 만족하게 된다.


다음으로 electrode current 로 %5Cfrac%20%7B%20%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20r%20%7D%20%7D%7B%20A%20%7D%20을 곱한다. 그래서 total membrane resistance인 %5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20R%20%7D%20이 나온다


결과적으로, basic equation은 

%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20%5Ctau%20%20%7D%5Cfrac%20%7B%20dV%20%7D%7B%20dt%20%7D%5Cquad%20%3D%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20E%20%7D%5Cquad%20-%5Cquad%20V%5Cquad%20%2B%5Cquad%20%5Ccombi%20_%7B%20m%20%7D%7B%20R%20%7D%5Ccombi%20_%7B%20e%20%7D%7B%20I%20%7D%5Cquad%20%5Cquad%20%20 로 표현할 수 있다.


여기서 만약 V%20가 %5Ccombi%20_%7B%20th%20%7D%7B%20V%20%7D%20에 닿게 되면 action potential이 일어나게 된다.

%5Ccombi%20_%7B%20L%20%7D%7B%20E%20%7D%20은 model cell의 resting potential이다.




당연하게도, 간단한 회로는 action potential을 생성해낼 수 없다.

하지만 특정한 threshold potential에서 membrane capacitor가 충전될 때,

capacitor가 discharge되면서 action potential이 생성될 수 있다.

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